국내 최초의 생명정보학 응용 소프트웨어 활용 지침서
생명정보학(Bioinformatics)은 생물학 연구에 컴퓨터와 분석 소프트웨어를 활용하는 응용과학으로 최근 크게 주목받고 있는 분야이다. 지난 몇 년간 이뤄진 유전체 연구의 성과로 엄청난 분량의 새로운 생물학 데이터가 축적되면서 이를 저장하고 관리하는 문제가 초미의 관심사가 되고 있다. 따라서 이제는 컴퓨터 기반의 도구를 사용하지 않고 단지 열정만으로 연구를 수행할 수는 없게 되었다. 생물학자는 시스템 관리부터 리눅스 클러스터 구축, 펄, 파이썬, 자바, MySQL을 배우고 있으며, 컴퓨터 과학자는 생화학, 유전학, 진화 간의 미묘한 차이를 이해하느라 씨름하고 있다. 생명정보학은 바로 이러한 문제를 해결하기 위한 각종 도구를 만들어내는 것과 관련된 학문이다.
이 책은 생물학 기반의 BT 연구자가 대규모 바이오 데이터 분석용 소프트웨어에 대한 지식을 습득하려 하거나, 평소 컴퓨터 사용이나 소프트웨어 개발에 익숙한 IT 연구자가 생명정보학의 제반 문제와 여기에 사용되는 소프트웨어 도구의 특성을 공부하고자 할 때 아주 광범위하고 유용한 기초 지식과 정보를 제공해 줄 것이다
주요내용
- 생명정보학 워크스테이션 설정
- 생물학 연구자를 위한 유닉스 시스템
- 생물 유전자 서열, 유전체, 분자 구조 등의 정보를 데이터베이스에서 탐색하는 전산학 기법
- 유전자 패밀리를 구분짓는 유전자 식별 및 개체 유형 검색 도구
- 계통발생학적 관계, 분자 구조, 생화학적 특성 등의 모델을 만드는 도구
- 데이터 관리 및 데이터 분석 과정 자동화
- 데이터베이스 구축
- 데이터 마이닝과 데이터 시각화 도구